在计算机系统的监控下，瓶子随输送带的输送依次进入隧道灭菌烘箱的预热区、高温灭菌区（温度≥5min）和低温冷却区。输送带速度无级可调，温度监控系统设置无纸或有纸记录。整个过程始终处于百级层流保护之下。

隧道烘箱加热元件安装在烘箱顶端，提高了热效率。烘箱配有电器控制柜，温度数显控制。可控制在任一恒温状态。出口处可采用和100级洁净度垂直层流的净化对物料进行冷却使物料处于严格无菌无尘状态。烘箱保温层内采用硅酸铝作为保温材料，保温性能良好。